海德堡水箱过滤对改善水环境状况起到了重大作用，但污水处理厂的尾水出路问题一直未得到有效解决. 许多污水处理厂将尾水直接排入天然水体,巨大的排放量超过天然水体的水环境容量，加剧水环境的污染. 因此尾水问题引起了社会各界的广泛关注，并对尾水深度处理及排放做了大量研究 ，生物滤池、 人工湿地等尾水深度处理技术以及尾水排放系统也应运而生. 这些措施在一定程度上降低了尾水排放对自然水体的冲击. 但是在人们关注尾水对自然水体水质产生影响的同时，却忽略了尾水中存在的大量微生物对自然水体生态平衡及附近人群可能造成的危害.

城市污水中含有大量的微生物，其中相当一部分为病原菌，如： 沙门氏菌(Salmonella spp.)、 志贺氏菌(Shigella spp.)、 大肠埃希氏菌(Escherichia coli)、 霍乱弧菌(Vibrio cholerae)、 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、 弓形杆菌(Arcobacter spp.)等，可对人身体健康和社会经济造成严重危害. 研究发现这些病原菌主要是人源污水微生物，污水处理工艺对其有一定去除效果，消毒可使病原菌的数量大大降低，但有些微生物生存能力强，能够产生芽孢和孢子，难以去除. 目前对城市污水的微生物学评价多采用细菌总数和总大肠杆菌数，但粪大肠菌群与其他尾水常见病原菌相关性较低，而不能有效代表全部的微生物或病原菌. 国内对尾水安全的研究起步较晚，主要集中于消毒、 尾水排放对受纳水体影响和部分回用水的微生物安全研究. 文献采用定量聚合酶链式反应技术(qPCR)建立了尾水中某些病原菌的定量检测方法，证实了尾水中病原菌定量检测的可行性. 但均未对尾水微生物的群落结构进行详细的分析.